ブログはコメント欄で応答するのが苦手なので、トラックバックの受付だけにしています。トラックバックURLはsingle.phpを書き直して表示されるようにしましたが、So-netブログよりトラックバックを送信してみてもうまく受け付けられません。
色々調べてSiteGuardが怪しかったのですが、結局、画像認証の影響でエラーが出ていたようです。画像認証を止めたらトラックバックを受け付けるようになりました。SiteGuardでピンバックを無効化しておいても受け付けてくれるようです。
コメントの方は復活するか考えている所です。